A nova identidade visual da revista foi alinhada à sua reestruturação editorial. Foram definidas 4 cores cores como representação das diferentes editorias e a família tipográfica Oculum foi desenvolvida pelo designer Paulo Chagas com base nos conceitos propostos e definidos entre a edição de arte e a direção da redação. 

A logomarca da revista Pesquisa FAPESP e seu desdobramento gráfico para o programa de rádio e podcast Pesquisa BRASIL utilizam a paleta de cores das editorias, de forma arepresentar as diferentes áreas do conhecimento que se sobrepõe e criam novas cores, simbolizando a transdisciplinaridade.

O novo sistema de grid e colunagem do projeto gráfico foi calculado de forma para acolher tanto seções curtas como grande aberturas de matérias longas, para trazer coesão, equilíbrio e fluidez na leitura e navegabiidade da revista. 

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